Site de Recherche Intégrée sur le Cancer
Rechercher
Actualité - Publications

ChromSCape: un outil pour l'analyse interactive des profils de chromatine en cellule unique

Equipe SIRIC
07/12/2020
Partager
Une application ShinyR
Nature Communications journal logo

Le développement des outils d'analyses "single cell" est en passe de révolutionner la recherche sur le cancer. L'exploitation de cette technique nécessite la mise en place d'outils pour gérer ces données. 

La plateforme Single Cell à l'Institut Curie, soutenue par le SIRIC depuis ses débuts, poursuit le développement des techniques "à façon" depuis sa création. Dans ce cadre, Prompsy et al propose ChromSCape: une application Shiny facile à utiliser.

Cet outil facilite l'interprétation biologique des paysages epigénomiques au sein des populations cellulaires et permet à l'utilisateur d'identifier différentes sous-populations dans des échantillon hétérogènes ainsi que des gènes et des voies associées.

 

Nos projets single cell: aller plus loin

En savoir plus
Puzzle
Actions structurantes

Les SIRICs jouent un rôle structurant pour développer le continuum soin recherche au sein de leur structure. Le…

Actualités liées